福州大學(xué)生物科學(xué)與工程學(xué)院導(dǎo)師：呂暾 正文

　　姓名：呂暾　　
　　性別：男　　
　　職稱：研究員　
　　學(xué)院：生物科學(xué)與工程學(xué)院
　　電子郵件: lvtun@yahoo.com
　　電話: 13338292585
　　　

　　個(gè)人簡(jiǎn)歷：

　　所受教育
　　物理化學(xué)博士 (20002-2007)
　　韋恩州立大學(xué)(美國(guó))　　化學(xué)系　　　　　計(jì)算機(jī)工程碩士 (2001-2002)
　　韋恩州立大學(xué)(美國(guó))　　計(jì)算機(jī)工程系　　生物化學(xué)碩士 (1996-1999)
　　清華大學(xué)　　　　　　　生物系　　　　　生物化學(xué)學(xué)士 (1991-1996)
　　廈門大學(xué) 　　　　　　生物系

　　工作經(jīng)歷
　　2008-目前　　福州大學(xué)生物科學(xué)與工程學(xué)院 研究員
　　從事功能蛋白工程的研究，目前關(guān)注抗體，疫苗，工業(yè)用酶

　　2007-2007　　美國(guó)韋恩州立大學(xué)醫(yī)學(xué)院 助理研究員
　　研究Melatonin對(duì)嗜酸性蛋白過氧化物酶EPO的抑制作用和EPO抑制藥物的初步篩選和設(shè)計(jì)

　　2002-2007　　美國(guó)韋恩州立大學(xué)化學(xué)系 助理研究員
　　計(jì)算化學(xué)并行程序的開發(fā)

　　2001-2002　　美國(guó)密歇根大學(xué)技術(shù)學(xué)院 講師
　　Bioinformatics Certificates 資格考試培訓(xùn)

　　參與的課題
　　束縛環(huán)境下的化學(xué)反應(yīng)機(jī)理

　　高性能并行計(jì)算集群系統(tǒng)的分布式文件系統(tǒng)開發(fā)

　　HIV 蛋白酶點(diǎn)突變與HIV多重抗藥性相關(guān)性研究

　　基于距離幾何的水稻金屬硫蛋白三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)方法
 

　　個(gè)人簡(jiǎn)介：
　　1.技術(shù)平臺(tái)：
　　1.1 生物大分子模擬：運(yùn)用分子動(dòng)力學(xué)模擬軟件，對(duì)蛋白質(zhì)、核酸等生物大分子的性質(zhì)進(jìn)行研究，探索結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系。
　　1.2 計(jì)算機(jī)輔助蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)：對(duì)蛋白質(zhì)的氨基酸序列進(jìn)行設(shè)計(jì)以提高目標(biāo)蛋白的性能，例如抗體的親和力，蛋白的熱穩(wěn)定性。
　　1.3 分子篩選與定向進(jìn)化系統(tǒng)：主要是噬菌體展示系統(tǒng)，目前利用它來篩選抗體，展示抗原表位。
　　2. 研究領(lǐng)域:
　　2.1 圍繞單個(gè)生物大分子的結(jié)構(gòu)與功能展開工作，通過分子的理性設(shè)計(jì)對(duì)藥物蛋白進(jìn)行改造、修飾，改善藥物蛋白的性能，如高效藥物蛋白的理性設(shè)計(jì)，藥物蛋白穩(wěn)定性的提高，篩選、設(shè)計(jì)新型酶, 功能多肽的設(shè)計(jì)等。3.2
　　2.2 圍繞生物大分子間最基本的相互作用“分子結(jié)合”展開工作，如通過研究抗原-抗體結(jié)合開展抗體藥物篩選，病毒中和抗體的篩選，病毒檢測(cè)試劑盒的研發(fā)，疫苗的設(shè)計(jì)等應(yīng)用研究。
　　2.3 生物大分子相互作用系統(tǒng)上，關(guān)注蛋白質(zhì)表達(dá)系統(tǒng)，基因表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，肝硬化，衰老分子生物學(xué)。

　　 承擔(dān)科研項(xiàng)目：

　　(1) 2008-2011 ?？蒲袉?dòng)基金：抗三聚氰胺單克隆抗體的篩選，犬細(xì)小病毒二代疫苗開發(fā)，抗體親和力成熟系統(tǒng)構(gòu)建。

　　(2）2008-2011年主持福建省青年人才創(chuàng)新基金：基于網(wǎng)絡(luò)服務(wù)模式和GPGPU的生物分子模擬軟件”（項(xiàng)目編號(hào)2008F306010107）

　　(3）2007-2008年參與美國(guó)NIH基金項(xiàng)目：“Melatonin對(duì)嗜酸性蛋白過氧化物酶的作用機(jī)理及其抑制藥物的初步篩選和設(shè)計(jì)”（項(xiàng)目編號(hào)R01 HL066367）。

　　(4）2001-2004年參與美國(guó)能源部基金項(xiàng)目: “納米尺度下的化學(xué)反應(yīng)動(dòng)力學(xué)”（項(xiàng)目編號(hào) DE-FG02-01ER15212）。

　　(5）2003-2005協(xié)助完成國(guó)家自然科學(xué)基金：“水稻莖部高效表達(dá)金屬硫蛋白基因啟動(dòng)子的鑒定”（項(xiàng)目編號(hào)30270753）。

　　(6）1999-2003協(xié)助完成國(guó)家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究專項(xiàng)基金:“光合作用高效光能轉(zhuǎn)化的機(jī)理”（項(xiàng)目編號(hào)G1998010100)。

　　教授課程： 生物信息學(xué)，計(jì)算生物學(xué)，系統(tǒng)生物學(xué)，儀器分析

　　論文發(fā)表

　　1. Isolation and identification of a ScFv Antibody against Melamine from a Rabbit Phage Display Library and its Structural Interpretation, Ailing Huang，Tun Lu，F(xiàn)ood Science and Biotechnology，20（6），1699-1704（2011）

　　2. 毒素DON單鏈抗體的同源建模及與DON結(jié)合的分子模擬研究, 鄭蓉 呂暾，化學(xué)學(xué)報(bào)，69（23），2882-2888（2011）
　　3.A Comparative Reverse Docking Strategy to Identify Potential Antineoplastic Targets of Tea Funtional Components and Binding Mode, R.Zhen，T.S.Chen，Tun Lu，International Journal of Molecular Science ，12, 5200-5212（2011） 4. 一種采用新的相似性度量方法的共調(diào)控基因動(dòng)態(tài)模糊聚類算法, 李小梅，郭紅，呂暾 福大學(xué)報(bào), vol39, 2, 198，（2011）
　　5. LU分解和Laplace算法在GPU上的實(shí)現(xiàn), 林江宏，林錦賢，呂暾 計(jì)算機(jī)應(yīng)用，v31,3,851，（2011）
　　6. 多核CPU和GPU加速分子動(dòng)力學(xué)模擬的實(shí)現(xiàn)， 陳穎，林錦賢，呂暾 計(jì)算機(jī)應(yīng)用，v31,3,843，（2011）
　　7. Classical Trajectory Studies of the D + H2 → HD + H Reaction Confined in Carbon Nanotubes: Effects of Collisions with the Nanotube Walls Tun Lu, et al., J. Phys. Chem. C ，114(19),9030-9040 （2010）
　　8. 一株產(chǎn)纖維素酶細(xì)菌的篩選，鑒定及產(chǎn)酶條件的優(yōu)化 呂靜琳，黃愛玲，鄭蓉，李典典，呂暾 生物技術(shù)，2009,19(6)
　　9. Classical trajectory studies of the D+H2->DH+H confined in carbon nanotubes: parallel trajectories Lu Tun, et al., J. Phys.Chem. C 2008, 112, 15260-15266 (IF 4.1)
　　10. Analysis of the Mechanism by which Melatonin Inhibits Human Eosinophil Peroxidase. Lu, Tun, et al., British Journal of Pharmacology 2008, 154(6),1308-1317 　　11. Chemical reactivity within carbon nanotubes: a qantum mechanical study of the D+H2->DH+H reaction Lu, Tun, et al., J. Phys. Chem. C 2008, 112. 2654-2659 (IF 4.1) 　　12. 有關(guān)阿爾茨海默病抗Aβ蛋白的藥物研究進(jìn)展 林旭 黃愛玲 洪安輝 呂暾, 海峽藥學(xué), 2008, 20(10), 1
　　13. Quantum States of Hydrogen and Its Isotopes Confined in Single-Walled Carbon Nanotubes. Lu, Tun, et al., J. Phys. Chem. B 2006, 110. 1742-1751 (IF 4.1) 　　14. Recent applications of iterative methods Goldfield, E. M.; He, Y.; Lu, T., et al., Abstracts of Papers, 225th ACS National Meeting 　　15. Aquifex aeolicus Aspartate Transcarbamoylase, an Enzyme Specialized for the Efficient Utilization of Unstable Carbamoyl Phosphate at Elevated Temperature Purcarea, C., Ahuja, A., Lu, T., et. al. J. Bio. Chem. 2003, 278, 52924
　　16. Quantum States of Molecular Hydrogen and Its Isotopes in Single Walled Carbon Nanotube. Lu, Tun, et all, J. Phys. Chem. B 2003,107. 12989-12995 (IF 4.1)
　　17. The Equilibrium Constants for Molecular Hydrogen Adsorption in Carbon Nanotubes. Lu, Tun, et al. J. Theo. Comp. Chem. 2003, Vol. 2. No. 4 621-625 (IF 1.0)
　　18. Modeling rice rgMT as a plant metallothionein-like protein by the distance geometry and homology methods Lu, Tun, et al. Acta Botanica Sinica 2003, 45, 1297 (IF 0.4)
　　19. Modeling the cysteine rich domain of plant metallothionein-like protein. He,H.; Zhu,C., Lu,T., et al. Acta Botanica Sinica 2002, 44(10): 1155-1159
　　20. Prediction for tertiary structure of metallothionein CAP3 from Colletotrichum gloeosporioides He, H.; Lu, Tun; et al. Shengwu Huaxue Yu Shengwu Wuli Jinzhan 2002, 29, 293
　　21. Hiv Protease Multidrug Resistance is Associated with the Loss of Key Contacts between the Protease and the Inhibitor. Kovari, L. C.; Cheng, P; Lu, T. Sitges, Spain 2000.
　　22. Classification and Nomenclature of Plant Metallothioein-like Proteins Based on Their Cysteine Arrangement Patterns Liu, J. Y., Lu, T. Acta Botanica Sinica. 2000, 42(6): 649-652.
　　23. 3D model for Kiwi503 by Distance Geometry and Homology Method. Zhu, C., Lu, T., et al. Chinese Science Bulletin, 2000, V45(6): 602-606.
　　24. Characterization of primary structure of rice ricMT, J. Tsinghua Univ. Lu, Tun, Liu, J. Y., 2000　Vol.40　No.6　P.29-32
　　25. Analysis of salicylic acid induced proteins in rice Shi, S., Pan, M., Lu, T., et al. Tsinghua Sci. and Tech. 1999, 4, 1519
　

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