建筑學(xué)：

  是東南大學(xué)的傳統(tǒng)強勢學(xué)科，建立于1927年，是我國成立的第一個建筑系，實力雄厚，全國建筑院系通用的教材有近1/3由東大編寫，全國建筑方面的國家級重點學(xué)科東南大學(xué)就占了1/3，特別是中國古建筑歷史方面，東南大學(xué)的地位更是其他院校無可比擬的，在國內(nèi)一直處于領(lǐng)先地位。
教學(xué)上實行教授負(fù)責(zé)制和導(dǎo)師負(fù)責(zé)制，使學(xué)生在大一的時候就有機會與博導(dǎo)、院士等進(jìn)行學(xué)習(xí)，形成了鮮明的特色。

  信息工程：

  是東南大學(xué)的一大驕傲，2006年1月，東南大學(xué)研制出中國第一塊符合3G移動通信技術(shù)規(guī)范的芯片，這宣告著我國躋身于世界移動通信強國的行列，現(xiàn)在國家新一代移動通信技術(shù)(4G)開發(fā)項目的總體負(fù)責(zé)人就是東南大學(xué)無線電工程系的尤肖虎教授。在未來五年，東南大學(xué)將建成移動通信國家實驗室。這里將成為我國移動通信方面與世界其他通信強國抗衡的最為重要的陣地。

  土木工程：

  近幾年迅速發(fā)展壯大，并開始向交通運輸工程、材料科學(xué)與工程、環(huán)境科學(xué)與工程、工程力學(xué)等領(lǐng)域拓展，蜚聲中外。學(xué)院教學(xué)與科研并重，設(shè)有為教學(xué)、科研服務(wù)的大型結(jié)構(gòu)試驗室、預(yù)應(yīng)力實驗室、力學(xué)實驗室、水力學(xué)實驗室、結(jié)構(gòu)力學(xué)實驗室、環(huán)境工程實驗室、計算機及CAD中心室和力學(xué)實驗中心。擁有國內(nèi)歷史悠久、專業(yè)藏書豐富的土木工程圖書館和資料室。

  生物醫(yī)學(xué)工程：

  是東南大學(xué)依托傳統(tǒng)優(yōu)勢學(xué)科去發(fā)展交叉學(xué)科與邊緣學(xué)科的一次成功的創(chuàng)新，他們的數(shù)學(xué)和數(shù)學(xué)系的知識深度和難度不相上下，電子方面的課程也可與電子系的一較高低，除此之外還要在醫(yī)學(xué)院學(xué)習(xí)一年的醫(yī)學(xué)知識，真可謂是樣樣精通了，經(jīng)過這些年的努力，東南大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)科已經(jīng)處于國內(nèi)同學(xué)科的領(lǐng)先地位。

  電子科學(xué)與技術(shù)：

  專業(yè)以寬口徑培養(yǎng)電類人才為主要特色，實行學(xué)生在低年級時先不分專業(yè)，高年級后，可根據(jù)自己的興趣、愛好及對各個學(xué)科的了解選擇校內(nèi)電類的任何專業(yè)，因材施教。