工程碩士與工學碩士兩者屬于不同的教育體系。工程碩士教育側(cè)重于工程素質(zhì)培養(yǎng)和工程實踐能力訓練；工學碩士是我們一般所說的統(tǒng)招工科類研究生，側(cè)重于基礎(chǔ)理論學習和學術(shù)研究。

工學碩士，指須參加1月份舉行的全國碩士統(tǒng)一招考，有碩士學位證書與學術(shù)型學位，其目的是培養(yǎng)具有扎實理論基礎(chǔ)，并適應特定行業(yè)或職業(yè)實際工作需要的應用型高層次專門人才。專業(yè)學位與學術(shù)型學位處于同一層次，培養(yǎng)規(guī)格各有側(cè)重，在培養(yǎng)目標上有明顯差異。學術(shù)型學位按學科設(shè)立，其以學術(shù)研究為導向，偏重理論和研究，培養(yǎng)大學教師和科研機構(gòu)的研究人員；而專業(yè)學位以專業(yè)實踐為導向，重視實踐和應用，培養(yǎng)在專業(yè)和專門技術(shù)上受到正規(guī)的、高水平訓練的高層次人才。專業(yè)學位教育的突出特點是學術(shù)型與職業(yè)性緊密結(jié)合，獲得專業(yè)學位的人，主要不是從事學術(shù)研究，而是從事具有明顯職業(yè)背景的工作，如工程師、醫(yī)師、教師、律師、會計師等。專業(yè)學位與學術(shù)型學位在培養(yǎng)目標上各自有明確的定位，因此，在教學方法、教學內(nèi)容、授予學位的標準和要求等方面均有所不同。

工程碩士分為全日制工程碩士和GCT工程碩士。工程碩士專業(yè)學位是與工程領(lǐng)域任職資格相聯(lián)系的專業(yè)性學位，它與工學碩士學位處于同一層次，但類型不同，各有側(cè)重。工程碩士專業(yè)學位在招收對象、培養(yǎng)方式和知識結(jié)構(gòu)與能力等方面，與工學碩士學位有不同的特點。工程碩士專業(yè)學位側(cè)重于工程應用，主要是為工礦企業(yè)和工程建設(shè)部門，特別是國有大中型企業(yè)培養(yǎng)應用型、復合型高層次工程技術(shù)和工程管理人才。