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　中國科學(xué)院亞熱帶農(nóng)業(yè)生態(tài)過程重點實驗室于2008年通過中國科學(xué)院評估，成為中國科學(xué)院重點實驗室。重點實驗室依托中國科學(xué)院亞熱帶農(nóng)業(yè)生態(tài)研究所，始建于2003年12月，為湖南省與中國科學(xué)院共同建設(shè)的重點實驗室，同時掛農(nóng)業(yè)生態(tài)工程湖南省重點實驗室的牌子。

　　重點實驗室主任由吳金水研究員擔任，現(xiàn)任學(xué)術(shù)委員會主任為傅伯杰研究員。現(xiàn)有固定人員38名，其中研究員12名，副研究員11名，技術(shù)支撐人員5人。擁有國家杰出青年基金獲得者1名，國家“百千萬人才工程”第一、二層次人選2名，引進國外杰出人才4名，湖南省杰出青年基金獲得者2名?，F(xiàn)有流動人員147人（博士后1人、在讀博士、碩士研究生共146名）。

　　實驗室設(shè)立亞熱帶農(nóng)田生態(tài)系統(tǒng)過程、亞熱帶農(nóng)牧復(fù)合生態(tài)系統(tǒng)過程和亞熱帶農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)功能及其調(diào)控機理3個研究方向。研究內(nèi)容包括亞熱帶三大類型區(qū)農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)格局、關(guān)鍵物質(zhì)循環(huán)調(diào)控與區(qū)域農(nóng)業(yè)資源高效利用優(yōu)化模式、區(qū)域退化農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)修復(fù)與農(nóng)業(yè)資源高效利用關(guān)鍵技術(shù)、水稻和玉米等作物耐逆境脅迫的分子生態(tài)學(xué)機理與雜種優(yōu)勢利用、農(nóng)業(yè)動物高效優(yōu)質(zhì)生產(chǎn)模式及環(huán)境安全控制技術(shù)等重點領(lǐng)域。

　　實驗室目前擁有基因芯片儀、飛行時間質(zhì)譜儀、植物生長箱、熒光定量實時PCR儀、生化分析儀、氨基酸自動分析儀、C/N分析儀、地理信息系統(tǒng)工作站等儀器設(shè)備，總價值2000余萬元。實驗室包括GIS與遙感應(yīng)用室、物質(zhì)循環(huán)室、動物養(yǎng)殖環(huán)境室、作物分子生態(tài)室等專業(yè)實驗室。與研究所兩個國家野外實驗臺站（桃源站和環(huán)江喀斯特站）以及正在建設(shè)中的洞庭湖濕地站和亞熱帶生態(tài)數(shù)據(jù)中心緊密合作，形成了完整系統(tǒng)的研究支撐體系。

　　重點實驗室近5年先后承擔國家973和支撐計劃項目（課題主持）、國家杰出青年基金和國家自然科學(xué)基金重點項目、百人計劃項目、中國科學(xué)院院知識創(chuàng)新重大項目和重要方向項目等重要科研任務(wù)共80余項，總經(jīng)費9120余萬元。

　　近5年重點實驗室取得了一批對區(qū)域農(nóng)業(yè)發(fā)展與生態(tài)環(huán)境建設(shè)有重大貢獻的研究成果。先后獲獲國家科技進步二等獎1項，湖南省科技進步一等獎3項、二等獎1項、三等獎3項，廣西區(qū)科技進步二等獎1項（第三）；出版專著4部，發(fā)表SCI論文61篇；獲得國家授權(quán)專利12項（其中發(fā)明專利10項、實用新型專利2項）。選育的3個新品種通過省級審定。

　　隨著知識創(chuàng)新工程的不斷推進，重點實驗室的國際影響逐漸擴大。先后與聯(lián)合國糧農(nóng)組織、英國洛桑試驗站、日本國立環(huán)境研究所、加拿大農(nóng)業(yè)部健康與營養(yǎng)研究中心、澳大利亞聯(lián)邦科工組織（CSIRO）等國際知名的研究機構(gòu)建立了長期合作研究關(guān)系。依托重點實驗室主辦的亞熱帶區(qū)域畜禽健康養(yǎng)殖與動物營養(yǎng)國際學(xué)術(shù)研討會、亞熱帶區(qū)域持續(xù)農(nóng)業(yè)國際學(xué)術(shù)研討會等得到了包括糧農(nóng)組織在內(nèi)的眾多國際農(nóng)業(yè)組織的積極響應(yīng)。