甘肅農(nóng)業(yè)大學水利水電工程學院前身是創(chuàng)建于1974的農(nóng)村水利電力專業(yè)，1999年更名為水利水電工程系，2003年與機電工程系合并組建工學院，2017年成立水利水電工程學院。學院現(xiàn)有在讀全日制本科生、研究生1232人。        
學院現(xiàn)設(shè)水利水電工程、農(nóng)業(yè)水利工程、水文與水資源工程、土木工程、測繪工程5個本科招生專業(yè)，其中水利水電工程專業(yè)和農(nóng)業(yè)水利工程專業(yè)為第一批次錄取本科專業(yè)?，F(xiàn)有農(nóng)業(yè)工程一級學科博士點1個，北方旱區(qū)作物生產(chǎn)裝備工程二級交叉學科博士點1個；農(nóng)業(yè)工程、水利工程省級重點學科2個；水利工程一級學科碩士點1個；農(nóng)業(yè)水土工程、北方旱區(qū)作物生產(chǎn)裝備工程二級學科碩士點2個；農(nóng)業(yè)工程領(lǐng)域工程碩士點1個，農(nóng)業(yè)機械化領(lǐng)域水利方向農(nóng)業(yè)碩士點1個。   

學院擁有農(nóng)業(yè)工程省級實驗教學示范中心、甘肅省節(jié)水農(nóng)業(yè)工程技術(shù)研究中心，并在校內(nèi)外建有多個實踐教學與研究基地、教學實習基地和產(chǎn)學研結(jié)合基地。與國內(nèi)外科研院所、高等院校有廣泛聯(lián)系與合作，參與《1+2+1中美人才培養(yǎng)計劃》項目。2010年6月，在甘肅農(nóng)業(yè)大學探索本科生“3+1”培養(yǎng)模式的基礎(chǔ)上，設(shè)有“3+1”人才培養(yǎng)模式的“大禹班”，設(shè)立了甘肅大禹節(jié)水集團股份有限公司研究生實踐基地。    
學院近年來先后主持和參與國家重點研發(fā)計劃項目課題、農(nóng)業(yè)部行業(yè)專項、國家自然科學基金、甘肅省科技重大專項等科研項目50余項；獲省級教學成果獎5項、省部級科研成果獎13項，其中省部級科技進步二等獎2項，三等獎10項；獲國家發(fā)明專利6項、實用新型專利50余項；在國內(nèi)外學術(shù)期刊發(fā)表論文500余篇，其中SCI、EI、ISTP收錄30余篇，出版教材17部；學術(shù)專著8部，校級精品課程4門。
學院現(xiàn)有教職工59人，其中教授8人，博士生導(dǎo)師1人，副教授13人，碩士生導(dǎo)師8人。享受國務(wù)院政府特殊津貼1人，入選國家百千萬工程國家級人選1人，甘肅省領(lǐng)軍人才第一層次人選1人，甘肅省 “555”創(chuàng)新人才工程第二層次人選2人，甘肅省“飛天學者”特聘教授1人，教育部高等學校農(nóng)業(yè)工程類專業(yè)教學指導(dǎo)委員會委員1人，甘肅省高等學校青年教師成才獎獲得者1人；教師結(jié)構(gòu)合理，多名教師先后到國外及國內(nèi)一流大學研修、訪學和學術(shù)交流。