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學校瞄準物質(zhì)科學與技術(shù)、生命科學與技術(shù)和信息科學與技術(shù)的前沿領(lǐng)域同時開展教授個體科研和圍繞重大目標的團隊科研，推動學科交叉融合、大學與國家級科研機構(gòu)融合，構(gòu)建科技進步驅(qū)動產(chǎn)業(yè)發(fā)展的完整創(chuàng)新價值鏈，針對國家在轉(zhuǎn)型發(fā)展過程中所面臨的一系列嚴峻挑戰(zhàn)，探索基于科技創(chuàng)新的解決方案。目前，物質(zhì)、信息、生命、創(chuàng)管學院以及免疫化學研究所、iHuman研究所已制定了學科/平臺建設(shè)規(guī)劃，常任教授、科研人員正陸續(xù)到位，截至2018年2月已建立157個研究組，科研工作全面開展，截至2018年2月，學?？蒲腥藛T共參與發(fā)表科研論文1886篇，其中第一作者及通訊作者論文729篇，“成功解析人源大麻素受體三維結(jié)構(gòu)”等高水平科研成果開始涌現(xiàn)。學校全力推進科技與教育的融合，參與中科院牽頭的國家級科研項目，與中科院相關(guān)院所建立聯(lián)合實驗室開展全面科研合作，2017年10月超強激光光源聯(lián)合實驗室實現(xiàn)10拍瓦（1拍瓦=1千萬億瓦）激光脈沖輸出，達到國際領(lǐng)先水平。學校積極推動科教與產(chǎn)業(yè)的融合，與多家國內(nèi)外高科技企業(yè)開展產(chǎn)學研合作，技術(shù)成果轉(zhuǎn)移轉(zhuǎn)化取得一系列進展。



       2016年4月15日，國務(wù)院發(fā)布《上海系統(tǒng)推進全面創(chuàng)新改革試驗加快建設(shè)具有全球影響力的科技創(chuàng)新中心方案》，明確指出上科大在上海張江綜合性國家科學中心建設(shè)中承擔重要任務(wù)。目前，學校正與中科院上海分院科研院所等單位合作，負責或參與建設(shè)軟X射線自由電子激光用戶裝置、活細胞結(jié)構(gòu)和功能成像等線站工程、超強超短激光實驗裝置、上海光源二期線站工程（納米自旋與磁學線站、高性能膜蛋白晶體學線站），牽頭硬X射線自由電子激光裝置的規(guī)劃和建設(shè)，承擔“多空間多時間尺度生物成像平臺”、“機器學習與虛擬現(xiàn)實平臺”等科創(chuàng)中心建設(shè)重點建設(shè)工作，力爭為上?？苿?chuàng)中心建設(shè)做出重要貢獻。



       學校積極投身教育全球化，與多所國際一流大學在學生培養(yǎng)、教師培訓(xùn)、課程共享、學術(shù)交流、合作科研等方面開展全方位務(wù)實合作，并積極拓展與國內(nèi)一流大學的交流合作關(guān)系。目前學校已與芝加哥大學、麻省理工學院、加州大學伯克利分校、耶魯大學、康奈爾大學、賓夕法尼亞大學、帕多瓦大學、牛津大學、德雷塞爾大學等歐美知名高校建立了良好的合作關(guān)系，在學生交流、課程開發(fā)、教師交流等方面開展項目合作，合作院校還在不斷增加。