2022年重慶郵電大學生物信息學院碩士研究生考試《生物信息學》大綱及參考書目

發(fā)布時間：2021-09-02 編輯：考研派小莉 推薦訪問：
2022年重慶郵電大學生物信息學院碩士研究生考試《生物信息學》大綱及參考書目

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2022年重慶郵電大學生物信息學院碩士研究生考試《生物信息學》大綱及參考書目 正文

《生物信息學（F052）》考試大綱》
命題方式 招生單位自命題 科目類別 復試
滿分 100
考試性質
復試科目
考試方式和考試時間
閉卷
試卷結構：
名詞解釋（20%）；填空題（20%）；分析題（30%）；綜合題（30%）；括號為題型大約占據的百分比。以實際考題為準。
考試內容和要求
1、生物信息學概念及其發(fā)展歷史：了解生物信息學發(fā)展歷史、主要研究領域和主要應用；理解并掌握生物信息學的概念。了解生物信息學發(fā)展面臨的主要問題和研究生物信息學所掌握的主要技能。掌握生物信息學   的常用網站 NCBI 等搜索生物信息學工具的方法。
2、生物數據庫及其檢索：了解生物學數據庫的內容和結構；了解生物學數據庫的數據存儲格式；掌握生物學數據庫的檢索方法。熟悉常用的生物學數據庫。
3、序列比對原理及應用：了解雙序列比對和多序列比對的概念；掌握常用的核酸和蛋白質打分矩陣；了解雙序列比對算法。了解多重比對算法，掌握常用的序列比對工具的使用方法。
4、基因組注釋：了解蛋白質編碼基因、重復序列和假基因的注釋方法。掌握 RNA 基因注釋方法。了解一種真核生物基因組注釋的案例。
5、蛋白質結構分析與預測：了解蛋白質結構組織層次；掌握蛋白質結構預測的常用方法；理解蛋白質對接和分子對接。了解與蛋白質折疊相關的疾病。
6、蛋白質組分析：了解蛋白質的大規(guī)模分離鑒定技術簡介；掌握串聯質譜鑒定蛋白質組方法及蛋白質組學概念。了解蛋白質的翻譯后修飾和分選的方法大規(guī)模分離鑒定技術簡介；掌握蛋白質相互作用網絡研究方法。 
7、轉錄組分析：了解轉錄組基本概念及轉錄組測序方法。掌握轉錄組分析的基本原理、方法和分析內容。   掌握一個轉錄組分析的案例。
8、非編碼 RNA 分析：了解非編碼 RNA 的分類；了解 miRNA 的生物合成和生物信息學分析方法。
9、分子進化與系統(tǒng)發(fā)育：了解分子進化與系統(tǒng)發(fā)育的概念；掌握幾種基于距離的系統(tǒng)發(fā)生樹構建方法。了解最大似然法、最大簡約法和貝葉斯方法的原理；了解基于全基因組數據的系統(tǒng)發(fā)生樹構建方法。了解系統(tǒng)發(fā)生樹構建的應用；掌握 Mega 軟件使用方法。
10、聚類算法及其應用：掌握基因表達分析基本概念；熟悉系統(tǒng)聚類基本概念；掌握 k-均值聚類算法基本思想；熟悉進化樹與系統(tǒng)聚類（UPGMA 算法）
11、隱馬爾科夫模型及其應用：了解 CG 島和“公平賭場”問題；掌握公平賭場和隱馬氏模型基本概念； 了解解碼算法；熟悉隱馬氏模型參數估計。
12、機器學習及其應用：掌握機器學習的概念，了解經典的機器學習算法。
13、新一代測序技術及其應用: 了解測序技術的發(fā)展過程；掌握第二代測序技術原理；了解第三代測序技
術；了解新一代測序技術在生物學研究中的應用。
參考書目
1、《生物信息學》（第 3 版）陳銘，科學出版社
2、《生物信息學：序列與基因組分析（英文版）》David W. Mount，科學出版社
備注
 
重慶郵電大學

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