2022年重慶郵電大學(xué)生物信息學(xué)院碩士研究生考試《生物信息學(xué)》大綱及參考書目

發(fā)布時間：2021-09-02 編輯：考研派小莉 推薦訪問：
2022年重慶郵電大學(xué)生物信息學(xué)院碩士研究生考試《生物信息學(xué)》大綱及參考書目

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2022年重慶郵電大學(xué)生物信息學(xué)院碩士研究生考試《生物信息學(xué)》大綱及參考書目 正文

《生物信息學(xué)（F052）》考試大綱》
命題方式 招生單位自命題 科目類別 復(fù)試
滿分 100
考試性質(zhì)
復(fù)試科目
考試方式和考試時間
閉卷
試卷結(jié)構(gòu)：
名詞解釋（20%）；填空題（20%）；分析題（30%）；綜合題（30%）；括號為題型大約占據(jù)的百分比。以實際考題為準。
考試內(nèi)容和要求
1、生物信息學(xué)概念及其發(fā)展歷史：了解生物信息學(xué)發(fā)展歷史、主要研究領(lǐng)域和主要應(yīng)用；理解并掌握生物信息學(xué)的概念。了解生物信息學(xué)發(fā)展面臨的主要問題和研究生物信息學(xué)所掌握的主要技能。掌握生物信息學(xué)   的常用網(wǎng)站 NCBI 等搜索生物信息學(xué)工具的方法。
2、生物數(shù)據(jù)庫及其檢索：了解生物學(xué)數(shù)據(jù)庫的內(nèi)容和結(jié)構(gòu)；了解生物學(xué)數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)存儲格式；掌握生物學(xué)數(shù)據(jù)庫的檢索方法。熟悉常用的生物學(xué)數(shù)據(jù)庫。
3、序列比對原理及應(yīng)用：了解雙序列比對和多序列比對的概念；掌握常用的核酸和蛋白質(zhì)打分矩陣；了解雙序列比對算法。了解多重比對算法，掌握常用的序列比對工具的使用方法。
4、基因組注釋：了解蛋白質(zhì)編碼基因、重復(fù)序列和假基因的注釋方法。掌握 RNA 基因注釋方法。了解一種真核生物基因組注釋的案例。
5、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析與預(yù)測：了解蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)組織層次；掌握蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測的常用方法；理解蛋白質(zhì)對接和分子對接。了解與蛋白質(zhì)折疊相關(guān)的疾病。
6、蛋白質(zhì)組分析：了解蛋白質(zhì)的大規(guī)模分離鑒定技術(shù)簡介；掌握串聯(lián)質(zhì)譜鑒定蛋白質(zhì)組方法及蛋白質(zhì)組學(xué)概念。了解蛋白質(zhì)的翻譯后修飾和分選的方法大規(guī)模分離鑒定技術(shù)簡介；掌握蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)研究方法。 
7、轉(zhuǎn)錄組分析：了解轉(zhuǎn)錄組基本概念及轉(zhuǎn)錄組測序方法。掌握轉(zhuǎn)錄組分析的基本原理、方法和分析內(nèi)容。   掌握一個轉(zhuǎn)錄組分析的案例。
8、非編碼 RNA 分析：了解非編碼 RNA 的分類；了解 miRNA 的生物合成和生物信息學(xué)分析方法。
9、分子進化與系統(tǒng)發(fā)育：了解分子進化與系統(tǒng)發(fā)育的概念；掌握幾種基于距離的系統(tǒng)發(fā)生樹構(gòu)建方法。了解最大似然法、最大簡約法和貝葉斯方法的原理；了解基于全基因組數(shù)據(jù)的系統(tǒng)發(fā)生樹構(gòu)建方法。了解系統(tǒng)發(fā)生樹構(gòu)建的應(yīng)用；掌握 Mega 軟件使用方法。
10、聚類算法及其應(yīng)用：掌握基因表達分析基本概念；熟悉系統(tǒng)聚類基本概念；掌握 k-均值聚類算法基本思想；熟悉進化樹與系統(tǒng)聚類（UPGMA 算法）
11、隱馬爾科夫模型及其應(yīng)用：了解 CG 島和“公平賭場”問題；掌握公平賭場和隱馬氏模型基本概念； 了解解碼算法；熟悉隱馬氏模型參數(shù)估計。
12、機器學(xué)習(xí)及其應(yīng)用：掌握機器學(xué)習(xí)的概念，了解經(jīng)典的機器學(xué)習(xí)算法。
13、新一代測序技術(shù)及其應(yīng)用: 了解測序技術(shù)的發(fā)展過程；掌握第二代測序技術(shù)原理；了解第三代測序技
術(shù)；了解新一代測序技術(shù)在生物學(xué)研究中的應(yīng)用。
參考書目
1、《生物信息學(xué)》（第 3 版）陳銘，科學(xué)出版社
2、《生物信息學(xué)：序列與基因組分析（英文版）》David W. Mount，科學(xué)出版社
備注
 
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