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學校本科專業(yè)涵蓋醫(yī)學、理學、工學、文學、法學、管理學、教育學7個學科門類；建有碩士學位授權(quán)一級學科4個，碩士專業(yè)學位授權(quán)點3個；江西省優(yōu)勢特色學科建設(shè)工程一流學科1個（培育），省高校“十二五”重點一級學科2個，省醫(yī)學領(lǐng)先學科1個。
江西省優(yōu)勢特色學科建設(shè)工程一流培育學科（1個）：臨床醫(yī)學。
江西省高校“十二五”重點一級學科（2個）：臨床醫(yī)學、基礎(chǔ)醫(yī)學。 
碩士學位授權(quán)一級學科（4個）：臨床醫(yī)學、基礎(chǔ)醫(yī)學、藥學、醫(yī)學技術(shù)。
碩士專業(yè)學位授權(quán)點（3個）：臨床醫(yī)學、護理學、公共衛(wèi)生。 

教學建設(shè)
截至2016年10月，學校建有國家特色專業(yè)2個，教育部、衛(wèi)生部卓越醫(yī)生教育培養(yǎng)計劃2項，教育部專業(yè)綜合改革試點項目1項，國家級大學生校外實踐教育基地建設(shè)項目1個，省特色專業(yè)4個，省卓越醫(yī)生教育培養(yǎng)計劃2項，省卓越工程師教育培養(yǎng)計劃1項，省專業(yè)綜合改革試點項目6項，省高校人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實驗區(qū)3個，省高校優(yōu)秀教學團隊4個，省高校實驗教學示范中心4個，省精品課程15門，省雙語教學示范課程3門，省精品資源共享課17門等110項各級各類本科教學工程項目。
國家特色專業(yè)（2個）：臨床醫(yī)學、麻醉學。
國家教育體制改革試點項目（1個）：探索“五年制”鄉(xiāng)鎮(zhèn)及社區(qū)醫(yī)務(wù)人員定向培養(yǎng)模式。
教育部、衛(wèi)生部卓越醫(yī)生教育培養(yǎng)計劃試點項目（2個）：農(nóng)村訂單定向免費醫(yī)學教育人才培養(yǎng)模式改革、“3+2”三年制?？迫漆t(yī)生培養(yǎng)模式改革的探索。
國家級大學生校外實踐教育基地（1個）：贛南醫(yī)學院第一附屬醫(yī)院臨床技能綜合培訓中心。
教育部專業(yè)綜合改革試點項目（1個）：臨床醫(yī)學
江西省高校特色專業(yè)（4個）：公共事業(yè)管理、護理學、預(yù)防醫(yī)學、運動人體科學。
江西省高校教學團隊（4個）：人體解剖學與組織胚胎學教學團隊、第一臨床醫(yī)學院外科學教學團隊、藥理學教學團隊、超聲醫(yī)學教學團隊。
江西省本科人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實驗區(qū)（3個）：藥學類專業(yè)復(fù)合應(yīng)用型人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實驗區(qū)、臨床醫(yī)學人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實驗區(qū)、麻醉學專業(yè)應(yīng)用型人才培養(yǎng)創(chuàng)新實驗區(qū)。
江西省卓越工程師教育培養(yǎng)計劃（1個）：藥學
江西省專業(yè)綜合改革試點（4個）：臨床醫(yī)學、預(yù)防醫(yī)學、麻醉學、護理學.
江西高校實驗教學示范中心（3個）：醫(yī)學形態(tài)學實驗教學中心、臨床技能實驗教學中心、醫(yī)學機能學實驗教學中心、藥學實驗教學中心。
江西省高校雙語教學示范課程（3門）：生物化學、系統(tǒng)解剖學、醫(yī)學微生物學。
江西省精品資源共享課（17門）：預(yù)防醫(yī)學、人體解剖學、超聲診斷學、麻醉藥理學、病理學、生物化學、醫(yī)用物理學、流行病學、護理學基礎(chǔ)等。
江西省高校精品課程（15門）：生理學、生物化學、外科學總論、毛澤東思想與鄧小平理論和“三個代表”重要思想概論、藥理學、人體解剖學、眼科學、超聲診斷學、臨床麻醉學、病理學、管理學基礎(chǔ)、預(yù)防醫(yī)學、醫(yī)學微生物學、診斷學、麻醉藥理學